Resecuenciación genómica

• Análisis de datos de DNA-Seq (Exomas, Genomas Completos y Secuenciación Personalizada)
• Detección de variantes genómicas y estructurales
• Anotación, filtrado y estudio de asociación de variantes

RNA-Seq

• Alineamiento de lecturas y cuantificación de la expresión de los genes/transcritos
• Análisis de datos de expresión RNA-Seq (Estudios de expresión diferencial, supervivencia, series temporales, clustering, co-expresión, predicción, selección de marcadores, etc.)

Single-cell

• Análisis de datos de RNA-Seq de célula única (alineamiento, cuantificación, caracterización de células (selección de características, reducción dimensional, clustering, visualización), identificación de genes diferenciales entre grupos de células, etc.)
• Análisis de datos de DNA-Seq de célula única (alineamiento, búsqueda de variantes, caracterización de células, etc.)

Secuenciación De Novo

• Ensamblaje de genomas
• Identificación y anotación funcional de genes
• Estudios de genómica comparativa (búsqueda de genes/clusters/funciones diferenciales, definición de pangenomas, comparación entre cepas, identificación de variantes, etc.)

Epigenómica

• Análisis de datos de ChIP-Seq y Methyl-Seq
• Identificación y estudio de regiones reguladoras de la transcripción
• Identificación y comparación de patrones de metilación

Microarrays

• Análisis de datos de microarrays de expresión y ADN de las plataformas Affymetrix, Illumina y Agilent
• Estudios de expresión diferencial, supervivencia, series temporales, clustering, co-expresión, predicción, selección de marcadores, etc.

Paneles de proteínas

• Control de calidad y normalización de los datos
• Análisis de datos (diferencia de cantidad de proteína, correlación con variante fenotípica, etc.)

Metagenómica

• Análisis de datos de secuenciación de Amplicones y Shot-Gun
• Control de calidad, tratamiento de lecturas secuenciadas, caracterización de la diversidad biológica y representación gráfica de los resultados.

Formación

• Organización e impartición de cursos
• Actividades de formación individualizada

Desarrollo de aplicaciones

• Programación de métodos y algoritmos de análisis de datos
• Creación de Webs dinámicas para la distribución de métodos y resultados científicos
• Diseño y programación de gráficos interactivos

Almacenamiento de datos de investigación

• Servicio de almacenamiento de datos de investigación
• Diseño, implementación y administración de bases de datos (p.ej. de pacientes, muestras, etc.)