Secuenciación De Novo
La secuenciación de genoma completo (WGS) hace referencia al examen de un genoma mediante la lectura y la unión de pequeños fragmentos para determinar la secuencia de ADN de cromosomas completos o mitocondrias. La secuenciación De Novo, hace referencia a secuenciar un organismo de nuevo, del cual no hay una secuencia modelo o de referencia. Las lecturas secuenciadas se ensamblan como contigs. Una vez que el genoma ha sido completamente secuenciado, ensamblado y anotado, se genera una sequencia de referencia.
Análisis Bioinformático
Un estudio clásico de secuenciación De Novo incluye lo siguiente:
- Control de calidad de las muestras, filtro de adaptadores y de lecturas de baja calidad.
- Ensamblaje de las lecturas para la generación de un genoma de referencia.
- Identificación de genes y anotación funcional.
- Análisis de la secuencia orientado en los objetivos del proyecto.
Resultados proporcionados por nuestro servicio
Nuestro servicio emplea métodos fiables y refrendados para el análisis de datos de secuenciación De Novo. Damos un servicio completo de análisis que va desde el Ensamblaje a la caracterización funcional y la genómica comparativa (ver figura).
El servicio incluye:
- Control de calidad e las muestras y corrección de errores
- Ensamblaje del genoma
- Identificación de genes
- Estudios de genómica comparativa (búsqueda de genes/clusters/funciones diferenciales, definición de pangenomas, comparación entre cepas, identificación de variantes, etc.)
- Caracterización metabólica
- Visualización de los resultados
